Python

Pythonとは？

スクリプト言語の1つ。（Mac OS X に標準搭載されている。）

豊富なライブラリモジュールが魅力？
- http://pypi.python.org/pypi

インストール

モジュールのインストールについて

python本体とモジュールの整合に注意が必要
- architecture：MacOSX 10.6 標準では， 64 bit (x86_64) の Python 2.6.1 と NumPy 1.3.0 がインストールされるとのこと．

インストール済みモジュールを調べる
- バージョン（例 numpy）

$ python -c "import numpy;print numpy.__version__"
1.3.0

- architecture（例 math）

$ python -c "import math;print dir(math);import commands;print commands.getoutput('file ' + math.__file__)"

- 調べ方が統一されているわけではない

site-packagesディレクトリ

モジュール情報が収められるディレクトリ

MacOSX 10.5標準pythonでの例

/Library/Python/2.5/site-packages

python-2.5.x.dmgでの例

/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.5/lib/python2.5/site-packages/

python本体のインストール

標準搭載版でないpythonをインストール http://www.python.org/download

python-3.1.x.dmg
python-2.6.x.dmg
python-2.5.x.dmg

Python 3.xのインストール

http://www.r-styles.net/mt-archives/weblog/development/python30-on-leopard.html

Pythonを支援する環境・ツール

IPython

python用の対話型シェル環境

Python標準シェルに比べて高機能

http://ipython.scipy.org/

setuptools

一部のモジュールに対して管理機能（インストール等）を提供

http://pypi.python.org/pypi/setuptools
easy_installコマンドも提供
インストール作業例

$ sh setuptools-0.6c11-py2.5.egg

モジュール

SciPy

科学技術計算関数を提供。

macports からもインストール可能。

SciPyについての説明等：

Mac OS X 10.5.7 Leopardへのインストール：http://d.hatena.ne.jp/yamato-y/20090608

SciPy 0.7 は Python 2.6 をサポート

NumPy

数値計算向け環境 http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/routines.html

関数抜粋とMATLAB比較： http://mathesaurus.sourceforge.net/matlab-numpy.html
NumPy 1.3 は Python 2.6 をサポート

Mac標準搭載Pythonで利用する場合には → http://radpy.blogspot.com/2009/06/numpymac.html

Matplotlib

2Dプロット環境

http://matplotlib.sourceforge.net/index.html

Matplotlib Basemap Toolkit

地図とデータをプロット http://matplotlib.sourceforge.net/basemap/doc/html/ http://www.scipy.org/Cookbook/Matplotlib/Maps

coastline データは GSHHS のもの(http://www.soest.hawaii.edu/wessel/gshhs/gshhs.html) ． state, country, river データは GMT のもの(http://gmt.soest.hawaii.edu)．

関連→ リスト/地球科学系

lxml

xml処理．

"Pythonic binding for the libxml2 and libxslt libraries" とのこと
http://codespeak.net/lxml
インストール例
- 情報元 http://muffinresearch.co.uk/archives/2009/03/05/install-lxml-on-osx/

$ curl -O ftp://xmlsoft.org/libxml2/libxml2-2.7.6.tar.gz
$ curl -O ftp://xmlsoft.org/libxml2/libxslt-1.1.26.tar.gz
$ curl -O http://codespeak.net/lxml/lxml-2.2.4.tgz
$ 
$ cd libxml2-2.7.6
$ ./configure --prefix=/usr/local/libxml2-2.7.6
$ make
$ sudo make install
$ cd /Library/Python/2.5/site-packages  # for Mac OSX 10.5 default Python
$ sudo ln -s /usr/local/libxml2-2.7.6/lib/python2.5/site-packages/* .
$ 
$ cd libxslt-1.1.26
$ ./configure --prefix=/usr/local/libxslt-1.1.26 --with-libxml-prefix=/usr/local/libxml2-2.7.6
$ make
$ sudo make install
$ cd /Library/Python/2.5/site-packages    # for Mac OSX 10.5 default Python
$ sudo ln -s /usr/local/libxslt-1.1.26/lib/python2.5/site-packages/* .
$ 
$ STATIC_DEPS=true easy_install
$ STATIC_DEPS=true sudo easy_install

obspy

地震計データの処理．http://svn.geophysik.uni-muenchen.de/trac/obspy/wiki/

インストール例

$ svn checkout https://svn.geophysik.uni-muenchen.de/svn/obspy obspy
$ cd obspy
$ python
>>> import commands
>>> list=["",'arclink','core','fissures','gse2','imaging','mseed','sac','seisan','seishub','signal','wav','xseed']
>>> for x in list:
>>>     if x != "": x = '.' + x
>>>     commands.getoutput('(cd obspy' + x + '/trunk; python setup.py develop)')

PyOpenGL

OpenGL for Python http://sourceforge.net/projects/pyopengl/

インストール例

$ tar xvzf PyOpenGL-3.0.1b1.tar.gz 
$ cd PyOpenGL-3.0.1b1
$ python setup.py install

テスト例

globe.py (minimum spanning tree on a sphere)を試す． http://www.treedub.org/blog/wp-content/uploads/2007/09/globe.tar.gz

$ python globe.py 20