「MPI」の版間の差分

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32bit コンパイラ:
 
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  $ ./configure --prefix=/opt/openmpi32 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort
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  $ ./configure --prefix=/opt/openmpi32 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort \
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    FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort
 
  $ make
 
  $ make
 
  $ sudo make install
 
  $ sudo make install
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コンパイラオプション '''CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64''' を追加する必要がある。
 
コンパイラオプション '''CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64''' を追加する必要がある。
  
  $ /configure -prefix=/opt/openmpi64 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64
+
  $ /configure -prefix=/opt/openmpi64 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort \
 +
    FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64
 
  $ make
 
  $ make
 
  $ sudo make install
 
  $ sudo make install

2009年3月13日 (金) 10:21時点における版

MPI とは?

Message Passing Interface の略で、並列・分散プロセス間のメッセージング機能を提供する標準規格。 あるいは、その実装を差す。1995年に MPI フォーラムによって標準化されて以来、多くの実装が存在していて、 コードの移植性に優れているのが特徴。言語に依存せず、C でも Fortran でも利用できる。

プログラム内に MPI 用のヘッダをインクルードして、 UNIX の fork プログラミングの要領で MPI 関数を追加していくだけで、 手軽に並列プログラムを作ることができる。

実装

Mac OS X で利用できるフリーの実装としては、以下のものがある。

LAM/MPI

daemon を介して、メッセージングを行う実装らしい。 現在はメンテナンスモードとなっていて、 開発者は後述の OpenMPI プロジェクトに合流しているそうだ。

MacPorts には、以下の Port が用意されている。

lammpi                         science/lammpi 7.1.2        MPI implementation for parallel computing


MPICH

最も広く使われている MPI 実装で、rsh/ssh 越しに通信を行うもの。 最近、新バージョンの mpich2 に移行しつつある。

インストール手順

  • ソースを展開して、手動で configure, make, make install を行う。
  • MacPorts には、以下の Ports が用意されている。
mpich                          science/mpich  1.2.7        Message Passing Interface (MPI) Library
mpich2                         science/mpich2 1.0.3        Message Passing Interface (MPI) Library


Open MPI

FT-MPI, LA-MPI, LAM/MPI, PACX-MPI などの さまざまな先行プロジェクトの成果をもとに 開発されている MPI 実装。

OSX 10.5 Leopard にはデフォルトで Open MPI がインストールされている。 ただし fortran サポートはオフになっており、mpif77 などは機能しない。 Fortran から MPI を使う場合は、ソースからビルドするか、MacPorts などのパッケージシステムを使う必要がある。

MacPorts

以下の Port が用意されている。

openmpi                        science/openmpi 1.1.2        A High Performance Message Passing Library

ソースからのインストール

OpenMPI プロジェクトのサイトから openmpi-1.3.tar.gz をダウンロードしたのち、 以下のようなオプションを configure に渡せばいい。 2つのパラメーター、F77 (fortran 77) と FC (fortran 90/95) に コンパイラのパスを直に渡せば良い。

32bit コンパイラ:

$ ./configure --prefix=/opt/openmpi32 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort \
    FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/ia32/ifort
$ make
$ sudo make install

64bit コンパイラ:

Developer Tools の gcc(デフォルト)を C コンパイラとして使う場合は、 コンパイラオプション CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64 を追加する必要がある。

$ /configure -prefix=/opt/openmpi64 F77=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort \
   FC=/opt/intel/Compiler/11.0/059/bin/intel64/ifort CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64
$ make
$ sudo make install

参考書籍

参考ページ

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